O Pavilhão "Fernandinho Simonsen" surgiu de duas grandes siglas: bondade e progresso. A enfermaria de Cirurgia Infantil e Ortopedia da Santa Casa de São Paulo, instalada no corpo do edifício do Hospital Central, devido a escassos recursos humanos e materiais, era nitidamente insuficiente para atender a Ortopedia que iniciava esplêndido progresso.
Em 1925 o menino Fernando Simonsen, teve um processo apendicular agudo, como era de praxe na época, aguardava o "processo esfriar" para ser operado, o que foi feito na Santa Casa, onde na época trabalhavam os melhores cirurgiões da cidade. Apesar de todos os cuidados recebidos, o menino faleceu de peritonite. O pai, Roberto Simonsen, grande industrial, filantropo e membro da Mesa Administrativa da Santa Casa, doou à Irmandade uma vultosa quantia destinada à construção de um prédio para a cirurgia pediátrica, em memória de seu filho.
Assim surgiu o Pavilhão "Fernandinho Simonsen" inaugurado em 19 de julho de 1931, sob a chefia do Prof. Dr. Luiz de Rezende Puech, o primeiro cirurgião geral que se dedicou exclusivamente às afecções ortopédicas, sendo portanto, o primeiro especialista do País. O Dr. Puech inconformado com a situação, desenvolveu por muitos anos uma verdadeira campanha pessoal para transformar e implantar uma nova mentalidade no conceito de ensino médico e hospitalar entre nós, fez estágios nos Estados Unidos e na Europa a fim de conhecer os melhores hospitais.
Com espírito preparado por madura reflexão e sabendo seguramente o que era necessário, dirigiu e assessorou os arquitetos na construção do Pavilhão Fernandinho, segundo planos, na época, verdadeiramente avançados e considerado modelo de funcionalidade e eficiência. O Pavilhão Fernandinho, quando da sua inauguração era, incontestavelmente, a melhor instalação médica e o primeiro hospital dedicado à Ortopedia da América Latina, e serviu de exemplo para que surgisse uma mentalidade verdadeiramente nova no conceito hospitalar entre nós.
Na ocasião da inauguração faziam parte do corpo clínico grandes nomes como Domingos Define, Godoy Moreira, Eugênio Longo, Amâncio Figueiredo, Loo Fraser, Orlando Pinto de Souza, Renato Bonfim, Itapema Alves e outros.
Em 19 de Setembro de 1936, foi fundada a Sociedade Brasileira de Ortopedia e Traumatologia, cujo seu primeiro presidente foi Rezende Puech, sendo inicialmente a sua sede o Pavilhão “Fernandinho Simonsen” até a década de 70.
Nesta época, a cadeira da faculdade que cuidava da Ortopedia era associada à Cirurgia Pediátrica, tanto que se chamava “Cirurgia Infantil e Ortopédica”. Somente em 1956, por iniciativa do Dr. José Soares Hungria, que trabalhava na enfermaria de Ortopedia de Adultos no Hospital Central (3a Cirurgia de Homens, onde era o chefe) é que foi feita a união da Ortopedia de Adultos com a Ortopedia Infantil, esta última sob a chefia do Prof. Dr. Domingos Define, que assumiu a Ortopedia após o falecimento do seu mestre Prof. Rezende Puech em 1939. Ao mesmo tempo a Cirurgia Pediátrica foi transferida para Departamento de Pediatria, ficando sob a direção do Dr. Fábio Dória do Amaral.
A Cadeira de Ortopedia da Faculdade de Medicina da USP, sob a chefia do Prof. Godoy Moreira, funcionou na 5a Cirurgia de Homens, desde a sua fundação em 1939 até 1944, quando foi transferida para o novo prédio no Hospital da Clínicas, na Av. Dr. Arnaldo. No Pavilhão Fernandinho continuou a funcionar a Cadeira de Ortopedia da Escola Paulista de Medicina, até o ano de 1960, quando foi transferida para o prédio da Escola Paulista, na rua Botucatu.
Em 1968, com a aposentadoria do Prof. Domingos Define, assumiu a chefia do Pavilhão, o Prof. Orlando Pinto de Souza, permanecendo por um ano. Assume então, o Prof. José Soares Hungria Filho que exerceu o cargo até 1980, tendo importante papel na estruturação funcional do Departamento de Ortopedia e de forma inovadora instituiu os primeiros módulos de grupos por especialidades.
A direção do Pavilhão Fernandinho passa ao Prof. Dr. Waldemar de Carvalho Pinto Filho no dia 4 de agosto de 1980, e continuou a estruturação do departamento em especialidades tornando o Pavilhão “Fernandinho Simonsen” em centro de referência e treinamento em ortopedia e traumatologia, nesse mesmo período exercia também a função de Diretor da Faculdade de Ciências Médicas da Santa Casa de São Paulo. O Prof. Dr. Rudelli Sérgio Andrea Aristide assume o cargo de Diretor do Departamento de Ortopedia em Setembro de 1989, tendo permanecido no cargo até 15 de Junho de 1994, esse período caracterizou-se pelo intercâmbio com diversos especialistas de renome internacional na área de Ortopedia e Traumatologia.
O Pavilhão “Fernandinho Simonsen” tem um importante papel na prestação de assistência em Ortopedia e Traumatologia à população; atende anualmente, cerca de 240.000 pacientes, 48.000 no Pronto Socorro fornecendo em média 4.000 aparelhos ortopédicos, e realiza aproximadamente 4.000 cirurgias. É referência no tratamento de várias afecções, contando atualmente no seu quadro funcional, com especialistas reconhecidos nacional e internacionalmente.